序列比对名词解释

如题所述

第1个回答  2023-01-06

序列比对名词解释如下:

为确定两个或多个序列之间的相似性以至于同源性,而将它们按照一定的规律排列。

将两个或多个序列排列在一起,标明其相似之处。序列中可以插入间隔(通常用短横线“-”表示)。对应的相同或相似的符号(在核酸中是A, T(或U), C, G,在蛋白质中是氨基酸残基的单字母表示)排列在同一列上。

这一方法常用于研究由共同祖先进化而来的序列,特别是如蛋白质序列或DNA序列等生物序列。在比对中,错配与突变相应,而空位与插入或缺失对应。序列比对还可用于语言进化或文本间相似性之类的研究。

序列比对的根本是发现潜在的同源序列,为所查询的序列进行功能预测及三维结构建模奠定基础。简单来说,相似性指序列比对过程中用来描述检测序列和目标序列之间相同DNA碱基或氨基酸残基顺序占的比例高低。

同源性是序列同源或不同源的一种论断,是个定性的概念,没有度的差异,而相似性是量化的。也就是说两条序列要么同源要么不同源,不可能具有多或少的数量关系。全局比对考虑序列的全局相似性,局部比对考虑序列片段之间的相似性

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