毕设基于PHP还是java语言更好

基于java好。
从找工作的角度说，PHP已经日薄西山了。

毕设并不排斥编程语言，只看论文的深度。
选择哪一个语言作为毕业设计，需要看自己主修哪个语言，在哪个语言上有更多知识积累。因为答辩环节可能会需要你对当前技术进行讲解，如果你对某一门语言基础没有足够的把握，那就需要慎重考虑了。

毕设无非商城网站，图书管理系统等等
说一下网上资源，java语言资源很多。去gitee搜索xxx商城一大堆现成的代码

看你就业的语言呗，其实对于毕业设计，无论是什么后端语言，其实都一样。