如题所述
第1个回答 推荐于2016-12-02
设计前blast比对，提醒下这是一个错误的认识，因此，要区别同源比对和验证比对，在对感兴趣的基因设计引物时，用的是同源比对，就是把物种上”近亲“的某个基因序列进行blast alignment，然后找出他们的保守片段，或者保守区间，在保守区间内设计引物，通过出来的成功率较高。这就是意义。
设计引物的步骤：a-同源比对找出保守区或片段，将保守片段复制出来保存为fasta格式；b-NCBI有个primer-blast，输入你复制出来的序列，然后设置你需要扩增的片段长度，点击提交按钮就可以得到候选引物；c-使用primer premier，详细方法网上很多，不再敖述
