如题所述
第1个回答 2022-12-09
yhbdxs:实验思路是这样的,将目的基因连接到含有GFP的表达载体上,得到GFP和目的基因的融合蛋白,再纯化。
我现在还没有选定用哪个载体,请你们帮帮我,太多不清楚的地方了。
E.coli:通常在进行原核表达实验时,选择使用pET系列载体居多。但是pET系列载体不带有GFP基因,其上的His Tag标签是专门用于分离纯化的。通常情况下,目的基因与GFP蛋白融合,用于真核表达的实验较多。
yhbdxs:谢谢E.coli的回答,我爱E.coli!!希望给我带来好运气!
由于时间紧迫,真核表达周期长,只能选择原核表达了。
1、用clontech的pGFP载体可以做原核表达吗?
2、先把目标基因连接到GFP载体上,切下来,连接到pET载体上,可以吗?
3、为什么pET系列载体不带有GFP基因啊?
E.coli:clontech的pGFP载体是原核表达载体,应该符合你的实验要求,但是我没有使用过,因此对其具体操作注意不是很了解。如果你一定要求使用pET载体表达带有GFP报告基因的目的基因,在进行载体构建时,加入GFP报告基因与目的基因融合应该是可行的。不过这样构建起来也是挺麻烦的,不如使用商品化载体方便些。
yhbdxs:在进行载体构建时,加入GFP报告基因与目的基因融合应该是可行的。
如果这样的话,是不是要用到一个辅助载体啊,就是说我一共要用三个载体:
目的基因先克隆到T载体送去测序,然后亚克隆到含有GFP的载体融合,最后再把融合基因连接到pET载体上,进行表达,是这样的思路吗?
我很急,一直在这里等着看结果呢,谢谢E.coli
E.coli:我认为在进行载体构建时,需要根据你的实验要求选择实验步骤:
1.如果在进行目的基因与GFP基因融合时,中间有酶切位点可以满足你的实验要求,可以:
1).将目的基因扩增后克隆至中间载体上测序。(目的基因去除终止密码子)
2).将1).测序好的片段通过酶切位点克隆至pET载体上。
3).如果你现有的GFP基因两侧的酶切位点满足已克隆目的基因的pET载体MCS的要求,可以直接将GFP基因克隆至2).构建好的载体上。
但是这样在目的基因与GFP基因间会存在有酶切位点,至少一个。并且在进行GFP基因克隆时,需要严格考查读码框的准确性,不可以移码。
2.如果在进行目的基因与GFP基因融合时,中间必须紧密相连,不允许有其它碱基,可以:
1).将目的基因扩增后克隆至中间载体上测序。(目的基因去除终止密码子)
2).克隆GFP基因,T载体即可。
3).使用1)./2).质粒为模板,设计引物搭链扩增目的基因与GFP基因,两侧加入与pET MCS相匹配的酶切位点。并克隆至T载体,测序。
4).将3).测序好的片段通过酶切位点克隆至pET载体上。
3.如果在进行目的基因与GFP基因融合表达后,你需要进一步将GFP融合蛋白切除,那么依据2.所示步骤,在进行第3).步搭链扩增时,还需要在搭链引物上设计蛋白酶识别位点,其余相同。以便在进行蛋白表达后,可以使用蛋白酶将GFP融合蛋白切除。
具体的蛋白酶识别位点设计情况,你可以参照pET Vector manual.
乱七八糟的,希望可以对你的实验有所帮助。
yhbdxs:今天下午和老板商量了一下,最终决定用clontech的pGFP载体,虽然还没有把握,现在我只能祈求自己好运气了!
wangjiali:你好:为什么不直接连在载体上酶切测序,还要连接在中间载体上测序?
E.coli:目的基因在进行扩增时,有可能会产生突变。将目的基因克隆至中间载体后,如果测序发现有突变,进行突变修复时比较容易操作。而且PCR产物进行TA克隆的难度远比酶切后克隆至表达载体的难度要小,阳性克隆率高,也比较有利于实验。
我现在还没有选定用哪个载体,请你们帮帮我,太多不清楚的地方了。
E.coli:通常在进行原核表达实验时,选择使用pET系列载体居多。但是pET系列载体不带有GFP基因,其上的His Tag标签是专门用于分离纯化的。通常情况下,目的基因与GFP蛋白融合,用于真核表达的实验较多。
yhbdxs:谢谢E.coli的回答,我爱E.coli!!希望给我带来好运气!
由于时间紧迫,真核表达周期长,只能选择原核表达了。
1、用clontech的pGFP载体可以做原核表达吗?
2、先把目标基因连接到GFP载体上,切下来,连接到pET载体上,可以吗?
3、为什么pET系列载体不带有GFP基因啊?
E.coli:clontech的pGFP载体是原核表达载体,应该符合你的实验要求,但是我没有使用过,因此对其具体操作注意不是很了解。如果你一定要求使用pET载体表达带有GFP报告基因的目的基因,在进行载体构建时,加入GFP报告基因与目的基因融合应该是可行的。不过这样构建起来也是挺麻烦的,不如使用商品化载体方便些。
yhbdxs:在进行载体构建时,加入GFP报告基因与目的基因融合应该是可行的。
如果这样的话,是不是要用到一个辅助载体啊,就是说我一共要用三个载体:
目的基因先克隆到T载体送去测序,然后亚克隆到含有GFP的载体融合,最后再把融合基因连接到pET载体上,进行表达,是这样的思路吗?
我很急,一直在这里等着看结果呢,谢谢E.coli
E.coli:我认为在进行载体构建时,需要根据你的实验要求选择实验步骤:
1.如果在进行目的基因与GFP基因融合时,中间有酶切位点可以满足你的实验要求,可以:
1).将目的基因扩增后克隆至中间载体上测序。(目的基因去除终止密码子)
2).将1).测序好的片段通过酶切位点克隆至pET载体上。
3).如果你现有的GFP基因两侧的酶切位点满足已克隆目的基因的pET载体MCS的要求,可以直接将GFP基因克隆至2).构建好的载体上。
但是这样在目的基因与GFP基因间会存在有酶切位点,至少一个。并且在进行GFP基因克隆时,需要严格考查读码框的准确性,不可以移码。
2.如果在进行目的基因与GFP基因融合时,中间必须紧密相连,不允许有其它碱基,可以:
1).将目的基因扩增后克隆至中间载体上测序。(目的基因去除终止密码子)
2).克隆GFP基因,T载体即可。
3).使用1)./2).质粒为模板,设计引物搭链扩增目的基因与GFP基因,两侧加入与pET MCS相匹配的酶切位点。并克隆至T载体,测序。
4).将3).测序好的片段通过酶切位点克隆至pET载体上。
3.如果在进行目的基因与GFP基因融合表达后,你需要进一步将GFP融合蛋白切除,那么依据2.所示步骤,在进行第3).步搭链扩增时,还需要在搭链引物上设计蛋白酶识别位点,其余相同。以便在进行蛋白表达后,可以使用蛋白酶将GFP融合蛋白切除。
具体的蛋白酶识别位点设计情况,你可以参照pET Vector manual.
乱七八糟的,希望可以对你的实验有所帮助。
yhbdxs:今天下午和老板商量了一下,最终决定用clontech的pGFP载体,虽然还没有把握,现在我只能祈求自己好运气了!
wangjiali:你好:为什么不直接连在载体上酶切测序,还要连接在中间载体上测序?
E.coli:目的基因在进行扩增时,有可能会产生突变。将目的基因克隆至中间载体后,如果测序发现有突变,进行突变修复时比较容易操作。而且PCR产物进行TA克隆的难度远比酶切后克隆至表达载体的难度要小,阳性克隆率高,也比较有利于实验。