如题所述
韦恩图
工具:Venny2.0
地址: http://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny/index.html
基因预测
工具:FGENESH
地址: http://linux1.softberry.com/berry.phtml?topic=fgenesh&group=programs&subgroup=gfind
phylogenetic
工具:iTOL
地址: http://itol.embl.de/index.shtml
启动子区预测
工具:Promoter Scan
地址: http://www.cbs.dtu.dk/services/Promoter/
蛋白质一级结构分析
工具:PredictProte
地址: https://www.predictprotein.org/home
工具:ExPASy-ProtParam tool
地址: http://web.expasy.org/protparam/
信号肽
工具:SignalP
地址: http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/
跨膜结构域
工具:TMHMM Server v. 2.0
地址: http://www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM/
蛋白质亚细胞定位
工具:PSORT II Prediction
地址: http://psort.hgc.jp/form2.html
蛋白质三级结构预测
工具:SWISS-MODEL
地址: http://swissmodel.expasy.org/interactive
短序列拼接
工具:Cap3
地址: http://doua.prabi.fr/software/cap3
多序列比对相似性展示
工具:SimiTriX-SimiTetra
地址: http://cotton.hzau.edu.cn/EN/tools/BioERCP/simitrix.php
绘制GO注释结果
工具:WEGO (Web Gene Ontology Annotation Plotting)
地址: http://wego.genomics.org.cn/cgi-bin/wego/index.pl
蛋白质domain
工具:Pfam database
地址: http://pfam.xfam.org/
基因组杂合性评估
工具:GenomeScope (Estimate genome heterozygosity, repeat content, and size from sequencing reads using a kmer-based statistical approach)
地址: http://qb.cshl.edu/genomescope/analysis.php?code=example2
circos****图
工具:CIRCOS (可以用来画基因组数据的环状图,也可以用来绘制其它数据的相关环状图。)
地址: http://mkweb.bcgsc.ca/tableviewer/visualize/