16个常用生物信息在线工具

韦恩图

工具：Venny2.0

地址： http://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny/index.html

基因预测

工具：FGENESH

地址： http://linux1.softberry.com/berry.phtml?topic=fgenesh&group=programs&subgroup=gfind

phylogenetic

工具：iTOL

地址： http://itol.embl.de/index.shtml

启动子区预测

工具：Promoter Scan

地址： http://www.cbs.dtu.dk/services/Promoter/

蛋白质一级结构分析

工具：PredictProte

地址： https://www.predictprotein.org/home

工具：ExPASy-ProtParam tool

地址： http://web.expasy.org/protparam/

信号肽

工具：SignalP

地址： http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/

跨膜结构域

工具：TMHMM Server v. 2.0

地址： http://www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM/

蛋白质亚细胞定位

工具：PSORT II Prediction

地址： http://psort.hgc.jp/form2.html

蛋白质三级结构预测

工具：SWISS-MODEL

地址： http://swissmodel.expasy.org/interactive

短序列拼接

工具：Cap3

地址： http://doua.prabi.fr/software/cap3

多序列比对相似性展示

工具：SimiTriX-SimiTetra

地址： http://cotton.hzau.edu.cn/EN/tools/BioERCP/simitrix.php

绘制GO注释结果

工具：WEGO （Web Gene Ontology Annotation Plotting）

地址： http://wego.genomics.org.cn/cgi-bin/wego/index.pl

蛋白质domain

工具：Pfam database

地址： http://pfam.xfam.org/

基因组杂合性评估

工具：GenomeScope （Estimate genome heterozygosity, repeat content, and size from sequencing reads using a kmer-based statistical approach）

地址： http://qb.cshl.edu/genomescope/analysis.php?code=example2

circos****图

工具：CIRCOS （可以用来画基因组数据的环状图，也可以用来绘制其它数据的相关环状图。）

地址： http://mkweb.bcgsc.ca/tableviewer/visualize/