如题所述
第1个回答 2022-06-28
常见的顺式调控元件是增强子,启动子,沉默子
文献 《Functional Classification and Experimental Dissection of Long Noncoding RNAs》 中对lncRNA的顺反式调控进行了讨论
对于顺式调控目前有三种类型:
1.lncRNA通过招募调节因子调节临近的mRNA基因的表达,(这里强调的是距离),比方说lncRNA结合到了临近mRNA基因的染色体大沟中,使得该mRNA基因在转录时pol ll由于空间阻塞无法结合,导致转录受抑制(本质上是由于lncRNA改变了临近mRNA基因的空间结构,从而影响mRNA的表达)
2.距离相近的lncRNA基因和mRNA基因若同时转录,由于转录所需的TF和pol ll等在空间中产生竞争,导致mRNA的转录效率下降。(这里同样强调距离,但是真正影响mRNA表达的是转录的空间阻塞,而不是lncRNA转录物)
3.lncRNA编码基因区含有mRNA的顺式调控元件,那么当lncRNA开启转录时,下游的mRNA就无法进行转录的增强,开启或,(这里强调的是顺式作用元件,如果含有的是增强子序列,那可能距离因素不是一个区分的重要因素)
因此,定义lncRNA顺式调控的因素,一个是lncRNA基因与调控的mRNA基因的距离,第二个是看lncRNA编码区是否含有某些mRNA基因的顺式作用元件
对于反式作用因子也有三种形式:
1.lncRNA调控mRNA基因表达,但是调控的mRNA基因要远离lncRNA编码的位点(考虑到距离因素),可能也是改变远端mRNA基因的空间结构,从而影响该mRNA的表达。 因此从这个角度区分顺反式调控实际上是在考虑距离因素
2.lncRNA影响核的结构,从而影响mRNA基因的表达(其中一个例子是lncRNA影响核斑,从而影响基因表达,核斑是一类蛋白质,属于反式作用因子)
3.lncRNA通过影响反式作用因子或者其他具有调控功能的RNA分子来影响基因表达
区分lncRNA的顺反式调控的依据主要有两个,一个是距离,另一个是是否与顺式作用元件(顺式调控)或者反式作用因子(反式调控)发生作用
文献 《Functional Classification and Experimental Dissection of Long Noncoding RNAs》 中对lncRNA的顺反式调控进行了讨论
对于顺式调控目前有三种类型:
1.lncRNA通过招募调节因子调节临近的mRNA基因的表达,(这里强调的是距离),比方说lncRNA结合到了临近mRNA基因的染色体大沟中,使得该mRNA基因在转录时pol ll由于空间阻塞无法结合,导致转录受抑制(本质上是由于lncRNA改变了临近mRNA基因的空间结构,从而影响mRNA的表达)
2.距离相近的lncRNA基因和mRNA基因若同时转录,由于转录所需的TF和pol ll等在空间中产生竞争,导致mRNA的转录效率下降。(这里同样强调距离,但是真正影响mRNA表达的是转录的空间阻塞,而不是lncRNA转录物)
3.lncRNA编码基因区含有mRNA的顺式调控元件,那么当lncRNA开启转录时,下游的mRNA就无法进行转录的增强,开启或,(这里强调的是顺式作用元件,如果含有的是增强子序列,那可能距离因素不是一个区分的重要因素)
因此,定义lncRNA顺式调控的因素,一个是lncRNA基因与调控的mRNA基因的距离,第二个是看lncRNA编码区是否含有某些mRNA基因的顺式作用元件
对于反式作用因子也有三种形式:
1.lncRNA调控mRNA基因表达,但是调控的mRNA基因要远离lncRNA编码的位点(考虑到距离因素),可能也是改变远端mRNA基因的空间结构,从而影响该mRNA的表达。 因此从这个角度区分顺反式调控实际上是在考虑距离因素
2.lncRNA影响核的结构,从而影响mRNA基因的表达(其中一个例子是lncRNA影响核斑,从而影响基因表达,核斑是一类蛋白质,属于反式作用因子)
3.lncRNA通过影响反式作用因子或者其他具有调控功能的RNA分子来影响基因表达
区分lncRNA的顺反式调控的依据主要有两个,一个是距离,另一个是是否与顺式作用元件(顺式调控)或者反式作用因子(反式调控)发生作用