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信号肽预测signalp6怎么分析
SignalP-6
.0:
信号肽预测
答:
2. 物种设定:根据你的研究对象,选择eukarya或euk(Sec/SPI专为真核生物设计),默认为其他。3.
预测
模型:选择fast、slow或slow-sequential,fast模式适合快速预览,而slow或slow-sequential提供更深入的
分析
。默认为fast。4. 性能优化:调整预测批次大小(BSIZE),...
SignalP
+TMHMM
预测
微生物分泌蛋白
答:
SignalP 6
.0的命令格式为:
signalp6
--fastafile /path/to/input.fasta --organism other --output_dir path/to/be/saved --format txt --mode fast推荐使用脚本run_SignalP.pl进行批处理和优化,该脚本从FASTA文件中读取并运行SignalP,生成结果文件。TMHMM的离线版有时可能会遇到问题,推荐使用网...
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