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如何通过蛋白质序列推测功能
蛋白质功能
预测的主要方法
答:
序列相似性比对
。通常情况下,蛋白质功能的预测方法采用序列相似性比对,结构和保守区分析等。序列相似性比对是蛋白质功能预测的最重要方法。
如何
推定一条新鉴定的
蛋白质序列
的生物学
功能
?
答:
1,
通过blast寻找其同源蛋白,如果有,再根据其同源蛋白的功能推测其功能,并实验检测
。2,如果没同源蛋白,那就麻烦了。建议先通过融合GFP确定该蛋白的亚细胞地位,上调、下调该蛋白,观察一些指标。
如何
阐明某个
蛋白
的基因结构与
功能
?简述其研究方法与步骤。
答:
【答案】:阐述某个蛋白质的基因结构:(1)用微量顺序仪测定该蛋白质的N-端30个氨基酸的序列
;(2)按照遗传密码预测相应于氨基酸序列的mRNA核苷酸序列;(3)用快速固相化学合成法合成一系列短的DNA片段,15~20核苷酸长,它们能和mRNA的部分序列形成互补碱基对;(4)将这些短的DNA片段和细胞总的mRNA杂交,...
softberry
如何
预测氨基酸
功能
位点?
答:
其中,
序列分析方法主要通过比对蛋白质序列与已知功能蛋白质序列的差异来预测氨基酸功能位点
;结构分析方法则主要基于蛋白质结构的信息来预测氨基酸功能位点;机器学习方法则是通过构建分类器来预测蛋白质中的氨基酸功能位点。
利用空间构象
如何推测蛋白质
的
功能
答:
1、
通过实验的方法预测蛋白质结构
,
即对蛋白质晶体使用X射线衍射或核磁共振,得到晶体电子密度等方面的信息,从而分析蛋白质结构
。这是结构生物学的方法。该方法结果准确可信,但是工作量大,难度也比较高。例如要结晶得到纯度高的蛋白质晶体有时候是很困难的,各种条件要慢慢摸索,往往要靠运气。2、用...
基因组信息学的
蛋白质功能
预测
答:
这个区域中那些与
功能
有关或可能与功能有关的氨基酸是否保守?这些问题通常需要借助合适的数据库搜索软件才能解决。
通过
合适的
序列
相似性搜索算法可对未知
蛋白质
进行家族归类。最常用的是BLAST算法,它主要基于相似片段的比较。通常一系列相似的序列可归为一个家族,并具有该家族特有的三维结构。在此基础上建立...
从
蛋白质
的氨基酸
序列
可预测其生物学
功能
这句话对吗?
答:
不对。
蛋白质
的
功能
取决于蛋白质的空间结构。也就是说即便是氨基酸
序列
相同,空间结构不同,生物学功能也不同。
目前,目前关于
蛋白质
的空间结构的预测有哪些方法和手段,效果
如何
?
答:
1、通过实验的方法预测蛋白质结构
,即对蛋白质晶体使用X射线衍射或核磁共振,得到晶体电子密度等方面的信息,从而分析蛋白质结构。这是结构生物学的方法。该方法结果准确可信,但是工作量大,难度也比较高。例如要结晶得到纯度高的蛋白质晶体有时候是很困难的,各种条件要慢慢摸索,往往要靠运气。2、用...
举例说明
蛋白质
一级结构与
功能
的关系
答:
3、血红蛋白的一级结构对于其氧结合和释放的能力至关重要。如果血红蛋白的一级结构发生改变,可能会导致血红蛋白的
功能
受到影响,例如在镰状细胞病中。抗体:抗体是一种能够识别并结合抗原的
蛋白质
,它们在免疫系统中起着关键作用。4、抗体的氨基酸
序列
是由重链和轻链组成的,它们之间
通过
二硫键相互作用,...
蛋白质序列功能
域
答:
一条
蛋白质序列
中的一段保守区域,该区域能够独立行使
功能
、进化等。 在蛋白质结构中,是一个蛋白质结构的一部分,能形成一个紧密的三级结构,能独立折叠且结构稳定,同样具有独立功能和进化等特征。目的:除了多序列联配的结果,用更好的方式描述功能域并应用。多序列联配结果中每一列出现最多的...
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