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表达蛋白大小和预测不符
物种没有测序,能否做
蛋白质
组呢?
答:
因为当前大量的物种已经测序,
预测
了相应的基因,未测序的物种可以通过近缘物种的基因序列作为数据库进行
蛋白质
组的研究。因此,一般来说,未测序物种可以考虑近缘物种的基因组序列作为数据库,可以做蛋白质组。推荐金开瑞生物,它们在这块做的很不错的。
谁帮我出生物试题?来看看要求
答:
4.软体动物种类很多,发布广泛,下列各组动物中不属于软体动物的一组是 A.蜗牛、章鱼、鱿鱼 B.河蚌、蛾螺、钉螺 C.扇贝、乌贼、田螺 D.蚯蚓、蛔虫、海星 5.放置在黑暗处的下述鱼缸中的鱼(鱼、缸
大小
均相同)最先死去的是 A.一缸清水2条鱼 B.一缸清水10条鱼和一部分水藻 C.一缸清水...
PIRPIR的功能
答:
PIR不仅限于序列数据,还涵盖了丰富的内容:包括
蛋白质
的名称、分类、来源信息,原始数据的引用文献,功能特性如基因
表达
、翻译后处理和激活等,以及序列中与功能相关的位点和功能区域。这使得PIR成为一个综合性的资源平台。为了满足不同需求,PIR提供了三种检索方式:(1)用户可以通过交互式文本查询,根据...
跨膜
蛋白
哪部分抗原性强?
预测
的B细胞表位位于胞质,怎么办?
答:
跨膜
蛋白
能够和外界配体结合的最合适位置只能是在胞外啊。
预测
到在胞质内貌似没太大的价值。 可能根据预测,胞内部分的抗原性强,但是没有办法实际去应用啊。楼主是用某种特异性的抗体去预测的吗? 如果真要找的话就用胞质外的那部分肽链中可能有口袋状或者突出状结构的位置进行一下预测。希望能够帮到...
发育同源
蛋白
对比
答:
在结构分析中,序列比对有助于发现序列中的保守模式或突变模式,这些模式蕴含着三维结构的关键线索。利用同源模型化技术,大约10%至30%
的蛋白质
结构可以被
预测
。然而,许多结构相似的蛋白质属于远程同源性,它们的同源序列可能只有不到25%。这意味着,即使空间结构相似,其序列等同性也可能低于这个阈值,传统...
如何
预测蛋白质
三维结构(SWISS-MODEL)
答:
Homology 、 UQANTA/CHARM 、 COMPOSER 、 CONSENSUS 、 MODELLER 和 Collar extension 等软件和方法可以用于目标蛋白结构模型的构建。 ③ 对模建结构基序优化和评估:同源结构模建(
预测
)得到
的蛋白质
结构模型,通常含有一些不合理的原子间接触,需要对模型进行分子力学和分子动力学优化,消除模型中不合理...
重磅!《Scientific reports》:可
预测
痴呆症进展的CSF生物标志物_百度知 ...
答:
研究首先根据MMSE测量结果定义了进展缓慢组和进展迅速组。基于特征重要性分析确定了具有
预测
价值的蛋白质生物标志物,并探索了每种排名靠前
的蛋白质与
认知能力下降率之间的关系。此外,还进行了功能富集和蛋白质-蛋白质相互作用分析,以深入了解快速和慢速进展者可能受到的不同生物学机制。通过定义快速和慢速...
SIFT :一个
预测
氨基酸替代是否影响
蛋白
功能的工具
答:
上图中,每行表示参考
蛋白
中的对应位置,每个位置下面是这条序列的氨基酸。每列表示20种氨基酸中的一种。每个条目报名一个氨基酸替换对应的某一个特定位置的分数,有害替换被红色突出标注。(2)位置
预测
氨基酸替代是否有害的阈值是0.05。氨基酸颜色说明:黑色表示非极性氨基酸,绿色表示极性不带电荷的...
ncbi
蛋白质
比对结果后会有保守域的
预测
,其中specific hit/non...
答:
non-specific hits meet or exceed the RPS-BLAST threshold for statistical significance (default E-value cutoff of 0.01,or an E-value selected by user via the advanced search options)照我理解的话,就是说specific hit就是铁定是这个家族的东西了,各种该保守的保守功能就跟这个家族的
蛋白
...
蛋白质
晶体解析深度全面详解!
答:
蛋白质结晶前准备 蛋白质结晶前,需充分了解目的蛋白质信息。这包括研究不同种属的蛋白,调查蛋白质的一级结构,
预测蛋白质
的三级结构和理化特性,以及分析蛋白质的配体和共价修饰。分子克隆技术是蛋白质结晶的基石。涉及获取目的基因,设计引物,采用传统和无缝克隆技术进行基因克隆。以某一基因进行操作演示,...
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