我做分子实验,PCR以后电泳监测空白对照居然有亮条带出现,一开始以为是污染,可以连续几次做都是这种情况

该出来的条带一直出不来,而空白对照一直又没有,好奇怪,求高人指点

有很多情况啊,像一楼说的,引物二聚体也可能,不过引物二聚体的位置在marker的末端,会比较模糊,比阳性对照的条带要粗。你可以截个图上来,让大家看看其他泳道上的带是什么情况。如果空白对照的亮带在别的泳道里也有,就是污染了,做PCR体系用的水很容易被污染,我的引物也有过污染的时候,电泳液里也可能留下跑胶时跑出去的核酸物质。不知道你P的是质粒,菌液,cDNA,还是细胞培养经过处理的产物。追问

是提取茶叶中微生物的真菌和细菌的DNA,这个是细菌的,最右边那个是空白,导师出差,也指导不了

追答

你图上一条暗红色,一条蓝色的带是buffer显的吧,一般正常的核酸带都是在两条buffer之间的,从这张图看,有很多带的那个泳道好像是marker吧,似乎跑的不太对,marker都会长于buffer显蓝色的带,我之前是做动物的,marker范围一般从10000到200,带有10条。不知道你提取的时候使用的是自己配的试液还是试剂盒提取的,看空白对照的那个带肯定有问题,如果是0.8-1%琼脂糖凝胶,220V以下的电压,跑15-20分钟的话,还停留在加样孔附近的带很有可能是细菌的蛋白残留,不知道你提取的时候使用的是自己配的试液还是试剂盒提取的,植物手提很容易做不出条带,可以换试剂盒试试,如果你真的想知道你空白对照里出现的是什么,可以进行胶回收,然后送测序或者连载体之类的,我以前也遇到过这种情况,结果胶回收产物连完载体都是空载体,然后我就把从提取到pcr,到跑胶的东西都换了。嗯,你们植物是有不一样的要求么?我们核酸琼脂糖凝胶电泳都是用黑白图的。我看报刊杂志也都是黑白灰色的。就上学的时候提过一次植物DNA,以后都做动物的了,回答的不够专业啊,你可以问问师兄师姐们,或者是给你们提供试剂的公司的技术服务。别耽误实验进度了。传一张我以前的电泳图给你参考一下,最底下模糊的亮带是引物二聚体,阴性对照也有的,阳性对照明显亮于样品带,marker是2k的。加样孔看的也很清楚,中间两排黑色的带就是buffer。

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第1个回答  2012-10-23
是引物二聚体吗?追问

我也不太懂啊,新手,导师也没讲太多。空白里面加的是去离子水,灭过菌的

追答

要不你做个阴性对照看看吧,初步估计应该是被污染了

第2个回答  2012-10-31
学习一下
第3个回答  2012-10-24
条带大小?
引物二聚体?
气溶胶污染?追问

胶是这样的,最右边是空白

追答

象是污染
整个体系仔细查一下
每个组份都查

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