如题所述
癌症的特异性生物标志物包括DNA、RNA、抗原、蛋白质或者多肽等生物分子。这些生物标志物的检测在诊断肿瘤类型、分析病程、指导治疗、检测复发或转移、判断预后等方面都具有重要价值。
肿瘤标记物的筛选一直是近年来研究的热点。科学家们通过构建肿瘤动物模型、单细胞测序、蛋白质测序等多种实验方法，筛选癌症及肿瘤的特异性标志物。然而，RNA、蛋白质在未知样本中的表达量未知，这为确定实验样本和检测手段带来了不少困扰。选择不合适的检测样本，即使采用优质的检测试剂或先进的检测技术，也无法得到理想的实验结果，从而浪费了时间和经济成本。那么，如何在检测之前了解样本中靶蛋白或RNA的表达量呢？
小优为您介绍一个功能强大的免费工具——The Pathology Atlas公开数据库。
(proteinatlas.org/humanp...)
The Pathology Atlas是The Human Protein Atlas数据库中提供疾病相关研究数据的部分，包含来自17种不同人类癌症的mRNA和蛋白质表达数据。
通过分析肿瘤组织中人类基因mRNA表达水平和近8000名癌症患者预后数据的相关性，得到18000多个具有显著性的结果(p <0.001)，提示特定基因的表达与特定肿瘤的发生发展存在联系。
此外，通过组织芯片(TMA)分析不同癌症类型的蛋白表达情况，得到了超过500万个癌症组织的免疫组化(IHC)结果图，提示特定蛋白的表达与特定肿瘤的发生发展存在联系。
The Pathology Atlas提供17种癌症类型的蛋白质组数据。
以肺癌为例，为您展示The Pathology Atlas提供的数据信息。
肺癌是世界上发病率和病死率最高的癌症，吸烟是主要诱因。研究结果表明，环境因素和遗传因素也可以诱导肺癌。肺癌患者预后较差，所有阶段病人5年生存率男性为13.6％，女性为19.4％。预后不良的部分原因是发现时已是晚期，同时也缺乏有效的治疗方法。
The Pathology Atlas使用TCGA转录组学数据和蛋白质的抗体验证数据展现肺癌的蛋白质组。由994例患者的转录组学数据获得与肺癌预后密切相关的651个基因，包括354个预后不良相关基因以及297个预后良好基因。
以GALNT2基因为例，The Pathology Atlas提供与该基因与不同癌症预后的相关性分析详细数据，可见GALNT2与肾癌、肺癌和宫颈癌预后的相关系数p<0.001，提示GALNT2与上述癌症类型密切相关。
The Pathology Atlas提供GALNT2在不同肿瘤组织中的IHC染色结果图，每个肿瘤类型提供数十个病人的年龄、性别、人种、癌症阶段、预后时间，以及生存散点图、生存分析、对应的肿瘤组织IHC染色结果图等信息。
GALNT2蛋白在不同组织器官中的表达量，可见GALNT2蛋白在胰腺中表达量高，在肾上腺、气管、结肠、肾脏等组织中表达量中等，在骨髓、淋巴结、脾脏等组织中表达量低，在心肌、唾液腺、平滑肌等组织中不表达。这些数据为科学研究的实验设计、检测方法提供了前期的参考数据。
Anti-GALNT2 Antibody的IF/IHC/WB验证结果图
本文也列举了肝癌、胃癌、乳腺癌和胰腺癌的不良与后续相关基因，临床数据的分析为上述癌症相关肿瘤标志物的研究提供新的可能。
针对上述不良预后相关的基因，小优为您推荐IHC相关的研究工具：
抗体
IHC二抗试剂盒
肿瘤标记物的筛选一直是近年来研究的热点。科学家们通过构建肿瘤动物模型、单细胞测序、蛋白质测序等多种实验方法，筛选癌症及肿瘤的特异性标志物。然而，RNA、蛋白质在未知样本中的表达量未知，这为确定实验样本和检测手段带来了不少困扰。选择不合适的检测样本，即使采用优质的检测试剂或先进的检测技术，也无法得到理想的实验结果，从而浪费了时间和经济成本。那么，如何在检测之前了解样本中靶蛋白或RNA的表达量呢？
小优为您介绍一个功能强大的免费工具——The Pathology Atlas公开数据库。
(proteinatlas.org/humanp...)
The Pathology Atlas是The Human Protein Atlas数据库中提供疾病相关研究数据的部分，包含来自17种不同人类癌症的mRNA和蛋白质表达数据。
通过分析肿瘤组织中人类基因mRNA表达水平和近8000名癌症患者预后数据的相关性，得到18000多个具有显著性的结果(p <0.001)，提示特定基因的表达与特定肿瘤的发生发展存在联系。
此外，通过组织芯片(TMA)分析不同癌症类型的蛋白表达情况，得到了超过500万个癌症组织的免疫组化(IHC)结果图，提示特定蛋白的表达与特定肿瘤的发生发展存在联系。
The Pathology Atlas提供17种癌症类型的蛋白质组数据。
以肺癌为例，为您展示The Pathology Atlas提供的数据信息。
肺癌是世界上发病率和病死率最高的癌症，吸烟是主要诱因。研究结果表明，环境因素和遗传因素也可以诱导肺癌。肺癌患者预后较差，所有阶段病人5年生存率男性为13.6％，女性为19.4％。预后不良的部分原因是发现时已是晚期，同时也缺乏有效的治疗方法。
The Pathology Atlas使用TCGA转录组学数据和蛋白质的抗体验证数据展现肺癌的蛋白质组。由994例患者的转录组学数据获得与肺癌预后密切相关的651个基因，包括354个预后不良相关基因以及297个预后良好基因。
以GALNT2基因为例，The Pathology Atlas提供与该基因与不同癌症预后的相关性分析详细数据，可见GALNT2与肾癌、肺癌和宫颈癌预后的相关系数p<0.001，提示GALNT2与上述癌症类型密切相关。
The Pathology Atlas提供GALNT2在不同肿瘤组织中的IHC染色结果图，每个肿瘤类型提供数十个病人的年龄、性别、人种、癌症阶段、预后时间，以及生存散点图、生存分析、对应的肿瘤组织IHC染色结果图等信息。
GALNT2蛋白在不同组织器官中的表达量，可见GALNT2蛋白在胰腺中表达量高，在肾上腺、气管、结肠、肾脏等组织中表达量中等，在骨髓、淋巴结、脾脏等组织中表达量低，在心肌、唾液腺、平滑肌等组织中不表达。这些数据为科学研究的实验设计、检测方法提供了前期的参考数据。
Anti-GALNT2 Antibody的IF/IHC/WB验证结果图
本文也列举了肝癌、胃癌、乳腺癌和胰腺癌的不良与后续相关基因，临床数据的分析为上述癌症相关肿瘤标志物的研究提供新的可能。
针对上述不良预后相关的基因，小优为您推荐IHC相关的研究工具：
抗体
IHC二抗试剂盒
温馨提示：答案为网友推荐，仅供参考
