知道基因全长,知道它的全部核苷酸序列,怎么找到它的空间构象和信号肽啊?有网站可以直接生成处出来么?

如题所述

你上NCBI,搜索该基因的蛋白,进入蛋白数据库,它会出现一张蛋白的序列表,点击左边的“sig_peptide”,就会直接高亮信号肽序列。右边structure一栏也能查到相关的蛋白结构。追问

基因要自己测,NCBI上面没有,测出来之后我怎么能找到呢?谢谢。

追答

你是说NCBI上没有这个基因的提交序列?
那你可以比对一下,查这个基因的同源序列的信号肽和空间结构,然后再推测你自己的那个。

追问

要是我把这个序列测出来了,能有什么方法找到它的空间结构和信号肽不?用同源性的,毕竟还是有点出入。谢谢...

追答

一般同源的蛋白的空间结构和信号肽都差不多的,一般推测蛋白结构就是从同源推的。你放数据库里BLAST一下,然后看同源性最高的那个蛋白,或者与物种是同科同属的其他物种的同源蛋白。你一看就明白了。

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