他为什么只留下医术、占卜和农书呢？他为什么要求长生？
焚书坑儒的起因，是因为当时一些儒生和游士引用儒家经典，借用古代圣贤的言论批评时政。而从更大背景看，是秦始皇统一文化的需要。
因为秦朝建立在六国的基础上，秦始皇灭六国后，为统一思想，推行“车同轨、书同文、行同伦”，应该说是很必要的措施。但由于一些“经书”中多有六国遗党颂六国先王的内容，秦始皇是不能容忍这种复辟可能性存在的，如儒者提倡依古制实行分封制的主张不合时宜等。而坑儒，则是很多方士接近始皇，以炼药寻丹为名，实乃是要传“道经”于天下。始皇恼羞成怒，认为方士们在耍弄自己。于是，先焚道经，后坑方士。
至于留下医术、占卜和农书，是听从了丞相李斯焚毁古书的建议。首先，李斯认为“儒生不师今而学古”“道古以害今”。如果任由这种不同思想存在下去，“如不加以禁止，则主势降乎上，党与成乎下，统一可能遭到破坏”。而“三代之争，何可法也”，也就是说长期治理思想争论不休，国家就不知道该遵照什么方法去治理了，这种思想混乱是不可持续下去的。所以，为了别黑白而定一尊，树立君权的绝对权威，他向秦始皇提出焚毁古书的三条建议：（1）除《秦纪》、医药、卜筮、农家经典、诸子和其他历史古籍，一律限期交官府销毁。令下三十日后不交的，处以黥刑并罚苦役四年；（2）谈论《诗》、《书》者处死，以古非今者灭族，官吏见知不举者，与同罪；（3）有愿习法令者， 以吏为师。
PS：秦始皇之所以晚年昏庸求长生，就是因为权力的欲望，毕竟秦始皇本身就是生在帝王之家，他深刻明白，当权力握在手中的时候才能决定一切，一旦死去，他就什么也不是了，他觉得自己如果这样与世长存下去，才能让自己的大秦江山万代长存，他才能永世被人传颂。
追问儒学出自于那里呢？
秦始皇为何要“焚书坑儒”？要搞清楚这个问题，我们需要结合当时的历史、政治背景来谈。
首先，“焚书”发生在秦国郡县制实行第八年，起因是博士齐人淳于越上书废除郡县制，主张恢复分封制。而该主张遭到了李斯的大力反对，驳斥了淳于越观点的同时，李斯提倡焚书，并禁止以私学非议朝政。其次，“坑儒”发生在“焚书”的第二年，起因是术士卢生和侯生没有为秦始皇求得不老仙药，为了掩饰自己的过错，便开始在私下诋毁、诽谤秦始皇。后被秦始皇发觉后，两人夺路而逃。由于二人的缘故，方士、术士开始失去了秦始皇的信任。
我们要明确一下“焚书坑儒”的内容，焚书，并不是要将所有的典籍烧的干干净净，主要焚的书有两类：一是六国的国史，二是民间各家学派著作，尤其是儒家典籍。坑儒，也并非要诛尽天下文人，而是一小部分的儒生和大部分的方士。
打江山容易，守江山难。秦始皇统一六国看似是取得了战争的胜利，但殊不知，真正的“战争”才刚刚开始。刚登基的秦始皇要面临的局面是六国百姓思想、语言、度量衡上的不统一，以及暗地里汹涌的复辟势力。而淳于越所主张的“分封制”，就是将复辟摆在了明面上，各诸侯恢复分封，便是瓦解秦国的首要步骤。从政治上说，“焚书”根本目的是国家教育与文化进行垄断，以此来统一思想。而“坑儒”则是秦始皇恼羞成怒，杀鸡儆猴，严惩办事不力之人。
秦朝不许学者们对朝廷的政治、经济等问题提出意见和批评，把很多书烧了，有谈论《诗》、《书》的人全都要处死，奉命求仙问药找不到还乱说话，秦始皇就将460多名方士和儒生在咸阳活埋在坑里了。
这是不是一种想永远占有、拥有权力的一种想法呢？可是他最后成功了吗？最后我们到底能从这个世界带走什么呢？儒学产自与那里呢？
