我现在有两段引物序列,如何通过BLAST来查到这对引物能扩增出的基因片段序列

如题所述

引物大吗?
如果二十几个bp以上的话,能查出来
正向引物不变,反向引物找反向互补序列,(就是说AATCGGATCCTCj就要翻成GAGGATCCGATT)把这两个序列用两个空格分开,或者用逗号隔开去blast,为了精确,应该在高级选项限制条件里选择你要的那种生物,你要的那种基因(比如是酶就选择酶那一类)。
然后在结果里认真找哈~~
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第1个回答  2012-11-17
在以下网址
Primer Parameterse下输入你的上下游引物序列
Primer Pair Specificity Checking Parameters下的Organism中输入你扩增的物种
再点击页面坐下方的“Get Primers”即可查看到扩增出的基因片段
第2个回答  2012-11-16
分别将正向引物直接放上去,反向的要反向互补下在放上去,分别blast出的全互补的基因看看。记下基因名和位置,有的这样能查出来。

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