明朝在位时间最长的皇帝是谁？

明神宗朱翊钧，48年。
明神宗朱翊钧（1563-1620），明朝第十三代皇帝。穆宗第三子。穆宗在位时立为太子，穆宗死后继位，年号万历，史称万历皇帝。神宗即位时，年仅十岁，主要由张居正辅政。张居正推行"一条鞭法"，使明王朝有所振兴。1582年朱翊钧亲政后，废止张居正的改革措施。他不常视朝，却大兴土木，营建宫苑，各地不断起义。神宗后期不问边计，对塞外女真蚕食疆土不以为意。在萨尔浒（今辽宁抚顺东南）惨败后，明对后金取守势，无力进攻。在明与后金的战争中，神宗三次下诏增派辽饷，加重了对内地的剥削，明朝从此走向灭亡。1620年八月病死，在位四十八年，终年五十八岁，葬于定陵。本回答被提问者采纳

太祖朱元璋，在位31年
惠帝朱允炆，在位5年
成祖朱棣，在位23年
仁宗朱高炽，在位1年
宣宗朱瞻基，在位11年
英宗朱祁镇，在位23年
景帝朱祁钰，在位9年
宪宗朱见深，在位24年
孝宗朱佑樘，在位19年
武宗朱厚照，在位17年
世宗朱厚璁，在位46年
穆宗朱载垕，在位7年
神宗朱翊钧，在位48年
光宗朱常洛，在位1月
熹宗朱由校，在位8年
思宗朱由检，在位17年

神宗显皇帝，名翊钧。穆宗庄皇帝朱载垕第三子，十岁即位，五十八岁崩，在位四十八年。

明神宗朱翊钧，年号为万历，中晚期的。在位48年
第二是他爷爷嘉靖，也就是朱厚熜，45年