小主板大显卡有问题吗

i5 2400+aywum散热器（挺大的）
华擎h61m u3s3（很小）
海盗船2*2g 1333（其中一根很接近u的风扇了）
技嘉 6850（很大）
还有一张pci网卡（占一个pci口）

首先我知道我的配置的短板是主板，那么这么配的话性能有没有什么问题？会不会因为主板不好影响其他的？

接着是主要问题：这样小的主板，比显卡还短显卡插入之后出了占了x16的口外，还遮住了一个pci口，遮住了一半的北桥散热片，非常靠近pci的网卡，也就是说网卡遮住了小半个显卡风扇。请问这样会不会有什么问题？