后来到底因为何事，两人闹翻？
左宗棠和曾国藩两人会闹翻是必然的结果。两人性格不相像，行军打仗的战略思想也是相反方向，可以说两人最终闹翻是对洪秀全之子死还是没死各抒己见，最终矛盾升级两人闹翻，但这里也有两人默契的存在。
左宗棠和曾国藩同时参加科举，左宗棠名落孙山，而曾国藩却扶摇直上，官路顺利。左宗棠因科举失败心灰意冷，决定回家教书，但他的野心也并没有放下。正当他郁郁不得志的时候，曾国藩找到他，并且说要带他入官场，这是左宗棠感觉很没面子，于是便自负地拒绝，但最后还是抵不住诱惑，在曾国藩的推荐下进入官场。
曾国藩对左宗棠非常的重视，他很用心的栽培左宗棠，但是左宗棠这个人比较自负，他对于曾国藩对他的栽培都会疑心的去揣测，曾国藩性格沉稳，做事比较小心，而左宗棠性格比较自负，也比较容易冲动，在平时的相处中两人开始出现摩擦。
曾国藩带兵打仗作战方法都想得比较完善，比较稳妥，左宗棠则是快速出击，寻求最有效快速的路径。两人闹翻还是在洪秀全的儿子这个问题上，曾国藩坚持洪秀全之子已经死了，但左宗棠则认为他没死，二人就此问题决裂，这只是明面上的决裂。
曾国藩和左宗棠都是清朝的大臣，二人也都明白功高震主，二人为了消除慈禧对他们的猜忌，他们两个很默契的选择决裂，以此让慈禧认为二人不和，从而放过他们。他们两个汉人在清朝的朝廷上手握重权，二人为了保命表面决裂是必然的。
晚清名臣左宗棠出仕的早年，曾在湖南巡抚骆秉章幕中赞襄军务，对抗太平军。在湖南的这几年间，左宗棠凭借其过人的才华和能力，蜚声内外，世间纷传湖南免遭太平军蹂躏，全赖左宗棠之功。
然而，左宗棠名声来得太快，位子却太低，只是骆秉章幕府中一小小师爷，因此也遭到了许多毁谤。最严重的一次，被湖广总督官文所参劾，差点丢了性命。
经历这次事件后，左宗棠被迫离开骆秉章幕府，辗转投靠曾国藩率领的湘军。
曾国藩可以说是继骆秉章之后，左宗棠的又一个伯乐。在曾国藩麾下，左宗棠得以再次大展拳脚。同治元年（1862年），在曾国藩的推荐下，左宗棠被提拔为浙江巡抚。同治二年（1863年），再次升迁为闽浙总督。
可以说，左宗棠能够扶摇直上，全赖曾国藩的成全。但就在同治三年（1864年），这两位亦师亦友关系的晚清名臣，却突然绝交，从此不通书信了。
在不知内情的人看来，左宗棠这样做似乎有些忘恩负义。不过左宗棠晚年时，有一次对曾国藩的弟弟曾国荃谈起两人绝交的原因，说“其过在文正（曾国藩）者七八，而自认其二三。”
到底曾国藩犯了什么错，导致左宗棠与他反目成仇呢？
话说同治三年（1864年），正是天京失陷，太平天国宣告灭亡的那年。而率军攻陷天京的，正是湘军的曾国荃所部。当时湘军的任务，除了占领天京，更重要的是抓获太平天国的首领洪秀全。
而天京城破后，曾国藩发现洪秀全已死，那么他的儿子“幼天王”洪福瑱（按：其真名为洪福，瑱为“真主”二字误认）就成了要抓捕的主要对象。
根据忠王李秀成的口供，洪福与他在城破时走散，已经死在乱军之中。曾国藩急于向清廷表功，没有查实这件事的真实性，就向朝廷汇报说，“洪福瑱积薪自焚”了。
不过，事实上洪福并未在乱军中死亡，而是先逃到了安徽广德，继而被太平天国的“堵王”黄文金迎入了浙江湖州。时任闽浙总督的左宗棠接到消息后，把这件事据实上报给了清廷。
军机处接左宗棠军报后，两宫太后和掌管枢廷的恭亲王均对曾国藩有些不满：
第一，曾国荃为了不让别人分他的功劳，一直违抗清廷命令，拒绝淮军帮忙合围天京，导致天京的攻陷比预计晚了几个月。
第二，曾国藩之前向军机处汇报，说天京攻防战中逃出来的太平军，已经“斩杀净尽”，但如今洪福明明在逃，可见湘军为了表功，有欺罔朝廷之嫌。
所以，清廷为此用了比较重的语气批评曾氏兄弟，要求他们尽快查明到底有多少敌军从天京逃出，并将防
二人绝交最主要的原因，是二人的政见不合。虽说曾国藩和左宗棠他们俩个同为晚清的重臣，刚开始认识的时候，甚至还以兄弟相称。但是这些都只是表面现象，曾国藩的城府比较深，而左宗棠为人就比较正直，二人在许多国家大事上的政见都不一样。后来愈演愈烈，导致二人直接绝交了。
他们二人绝交的导火索，是因为太平军幼主问题。当年曾国藩率领湘军打败了太平军，攻下了太平天国的首都天京，曾国藩直接上书朝廷，说洪秀全的后代已经死光了。而这时左宗棠就上书朝廷，说太平军幼主已经成功出逃，并且正在召集军队继续抗清。二人就这个问题连续上书争斗，把朝廷都给搞烦了。
其实从本质上来看，二人是为了争夺权力，才闹到了绝交这个地步。曾国藩剿灭太平天国有功，在当时的朝廷中是大红人，而左宗棠虽说也是朝廷重臣，可是一直处于不愠不火的状态。二人都想独揽朝中大权，所以才会闹僵。
