已知一个蛋白是跨膜蛋白,也已经知道其序列,请问如何得知其哪些序列是胞外段,哪些是跨膜段,哪些是胞内段?
可以通过分析氨基酸序列,首先确定跨膜区(疏水氨基酸,非极性的氨基酸一般成串出现在该区域)。然后再根据2段的同源结构来推测。典型的跨膜蛋白一般都是膜外为受体,膜内可能是酶活性中心。你可以分别把2端的序列做一个BLAST,找到相似的同源序列,看看带有同源序列的蛋白功能,就可以大致推测出你这个蛋白的结构了
温馨提示:答案为网友推荐,仅供参考