已知一个蛋白是跨膜蛋白，也已经知道其序列，请问如何得知其哪些序列是胞外段，哪些是跨膜段，哪些是胞内

可以通过分析氨基酸序列，首先确定跨膜区（疏水氨基酸，非极性的氨基酸一般成串出现在该区域）。然后再根据2段的同源结构来推测。典型的跨膜蛋白一般都是膜外为受体，膜内可能是酶活性中心。你可以分别把2端的序列做一个BLAST，找到相似的同源序列，看看带有同源序列的蛋白功能，就可以大致推测出你这个蛋白的结构了

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