如题所述
1、访问cran.rstudio.com/下载R软件,当前版本为4.1.1。下载完成后,选择一个文件夹存放,并开始安装。
2、启动R。在R环境中,输入以下命令:
if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
install.packages("BiocManager")
接着输入:
BiocManager::install(version = "3.13")
界面将显示安装过程。
3、接着输入以下命令:
BiocManager::install(“clusterProfiler”)
界面将再次显示安装过程。
4、为了确认clusterProfiler是否已成功安装,输入以下命令:
library(clusterProfiler)
如果出现“不存在叫‘DBI’这个名字的程序包”的错误提示,则需要安装DBI包,命令如下:
BiocManager::install(“DBI”)
安装完成后,再次执行检验clusterProfiler是否安装成功,如仍有未安装的程序包,则继续安装。
5、安装成功后的界面如图所示。
关于安装方法,可以参考网址bioconductor.org/instal...。但clusterProfiler包依赖的包较多,安装过程复杂,耗时长,且容易出现各种错误。对于刚开始接触的新手来说,理解这些术语可能有一定难度。因此,本文分享安装过程中遇到的问题及解决方法,以提高安装效率。
2、启动R。在R环境中,输入以下命令:
if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
install.packages("BiocManager")
接着输入:
BiocManager::install(version = "3.13")
界面将显示安装过程。
3、接着输入以下命令:
BiocManager::install(“clusterProfiler”)
界面将再次显示安装过程。
4、为了确认clusterProfiler是否已成功安装,输入以下命令:
library(clusterProfiler)
如果出现“不存在叫‘DBI’这个名字的程序包”的错误提示,则需要安装DBI包,命令如下:
BiocManager::install(“DBI”)
安装完成后,再次执行检验clusterProfiler是否安装成功,如仍有未安装的程序包,则继续安装。
5、安装成功后的界面如图所示。
关于安装方法,可以参考网址bioconductor.org/instal...。但clusterProfiler包依赖的包较多,安装过程复杂,耗时长,且容易出现各种错误。对于刚开始接触的新手来说,理解这些术语可能有一定难度。因此,本文分享安装过程中遇到的问题及解决方法,以提高安装效率。
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