为什么有的公文有发文字号，有的公文却没有？

文件的字号是用来识别发文单位的。

建国初期，国务院的文件也有“国发×字”的格式，其中的“×”是用来区分文件的类别的。后来，“中发”和“国发”的文件，没有了这个“字”字，直接编号来区别不同文件。

各地方党政的发文，也没有这个“字”字。如
川府发（2006）第78号 一望而知是的文件。
陕发＝陕西省委发文；黑委发＝黑龙江省委发文，陕政发＝陕西省政府发文......

现在在文件字号中带“字”字的，有这样几种情形：

几个部门联合发文，如
财政部、文件：（81）电财字第56号

某部门的下属部门发文，如

财政部税务总局发文：财政部（86）财税字第103号

某部门用来区别文件的类别，如
四川省财政厅[川财基(1999)09号] 是关于方面的文件。

这可能有两种原因，第一是因为人员的疏忽漏掉了文号，第二可能是因为公文内容具有特殊性，行文时故意隐去了文号。本回答被提问者采纳