如题所述
要回答这个问题，首先要了解恐龙的分类学。
恐龙隶属于爬行纲，双孔亚纲，初龙次亚纲，包括两个目：蜥臀目和鸟臀目，其中蜥臀目又分为蜥脚亚目和兽脚亚目，鸟臀目又分为鸟脚亚目，肿头龙亚目，装甲亚目和角龙亚目。在以上的分类阶元中，兽脚亚目通常为两足行走的肉食恐龙，鸟脚亚目和肿头龙亚目通常为两足行走的植食恐龙，其余通常为四足行走的植食恐龙。
为什么会有这样的差别呢？
一个很重要的原因是食性所导致的消化系统内脏大小的差异。在现生的哺乳动物中，我们可以观察到，肉食动物的肠道通常很短，为体长的3~4倍，盲肠不发达；而植食动物的肠道长度可达到体长的20倍以上，并有一个发达的盲肠。换言之，植食动物比肉食动物拥有大得多的内脏。
通常认为，早期出现的恐龙为兽脚亚目的成员（如始盗龙，腔骨龙等），都是两足行走的肉食恐龙。至于它们为什么两足行走，一说是为了拥有更高的视野。
后来恐龙发生了分化。蜥脚亚目由于适应植食，内脏急剧扩大，两足行走无法维持身体平衡，于是采用了四足行走的方式。此外，蜥脚亚目通常体型巨大，两足无法长时间负载其体重。
鸟脚亚目和肿头龙亚目在演化中出现了另一种方式：将巨大的内脏悬垂于两条后肢之间的腹腔中，因此得以维持两足行走。不过它们的前肢通常比兽脚亚目发达得多，很多种类可以实现两足与四足行走的切换。
而装甲亚目和角龙亚目由于在演化中出现了骨板（剑龙类），装甲（甲龙类）或颈盾（角龙类），身体的负荷相对于鸟脚亚目的祖先大辐度增加了，于是也选择了四足行走的方式。
第一，兽脚类全是严格的两足行走的动物，就是系统树里面写着“Theropods”的这一支恐龙（从这一支恐龙中演化出了鸟类），当然，有人认为北非的埃及棘龙是四足行走的。
但是绝大多数的兽脚类，可以肯定是专性的二足行走的，同时，绝大多数的兽脚类是肉食性的恐龙，只有极少数的例外。
第二，鸟臀类里面的异齿龙科（Heterodontosaurids）和肿头龙类（Pachycephalosaurs）是专性的二足行走恐龙，两者都是植食性的恐龙。
异齿龙科的孔子天宇龙（中国辽西）和肿头龙类的怀俄明肿头龙（北美洲）
第三，早期的鸟脚类（Ornithopods）中，二足行走是广泛存在的情况，但是到了后期的鸟脚类，比如演化到禽龙类阶段以后，一般认为这些类群是兼性的两足行走的动物，比如非常进步的鸭嘴龙科的巨型山东龙、棘鼻青岛龙等，这一类恐龙都是植食性的。
第四，蜥脚型类（Sauropodomorphs）、有甲龙（Thyreophorans）和角龙类（Ceratopsians）都是早期的种类专性或者兼性的二足行走，到了后期则变为四足行走。这一类恐龙绝大多数是植食性的。
当然，有人可能会质疑，为什么不能是四足行走为恐龙的祖征，而二足行走是恐龙的各个支系各自独立演化出来的特征呢？这就涉及到科学理论的简约性原则，如果两足行走是恐龙的祖征，则这一特征在很多支系仅需要变化一次，则二足行走变化为四足行走，而如果四足行走是恐龙的祖征的话，则这一特征在很多支系需要变化两次，即由四足行走变为二足行走再变为四足行走，同样可以解释一个现象的两个科学理论，在进一步的证据出现之前，我们当然选择更加简约的那一个，因此，目前，我们可以下结论：恐龙的祖先是种二足行走的动物，在恐龙的演化过程中，多个支系二次演化出四足行走的方式。
聊生物演化，目的论是大忌，虽然目前最新的研究表示目的性和策略性在宏观演化里面可能也有一定因素（过去只认为微观演化可能存在指向性因素），仍然应该按照系统分支学来讨论。
首先恐龙（含麻雀，三角龙类和雷龙的最大演化支）在羊膜动物里面的最大分类单元是真爬行动物，然后是双孔亚纲。在双孔亚纲里，含有鳞龙次亚纲和主龙型类两大类，其中恐龙属于主龙型类的主龙型下纲（Archosauria,希腊语为具有优势的蜥蜴，过去大陆的翻译古蜥，台湾的祖龙或者港译的初龙都是错误翻译）。主龙型下纲（排除基干的主龙形态类，始发于中二叠纪世，早三叠世经历了辐射演化）在早三叠世的时候辐射演化出了基干的几种主龙，到中三叠世（245ma）分化出了鸟颈类主龙和镶嵌踝关节类主龙两大分支。前者包含恐龙形态类和翼龙目两个姐妹演化支，后者包含波斯特鳄，植龙和鳄形超目（含现生鳄鱼和短吻鳄）。除了植龙类和中生代中真鳄类的狮鼻鳄（白垩纪晚期物种）。
大部分主龙都是食肉动物。有趣的是两腿行走和四肢垂直于躯干并非恐龙形态类独创，镶嵌踝关节类的派克鳄，一种被BBC与龙同行所鼓吹的恐龙祖先（实质上是鳄鱼的远亲，和恐龙的关系更是远上加远）也发展处了四肢垂直于躯干的身体结构。
古生物学家利用复原图推测其极可能在捕食的时候使用后肢两足直立奔跑。镶嵌踝关节类波斯特鳄的灵鳄更是发展出了与似鸟龙类相似的身体结构，而似鸟龙则是进步的虚骨龙类。
这说明尽管化石记录表示最基干的主龙是四足行走并且四肢类似两栖动物似的外八字与躯干下方，两足直立是相当大一部分肉食类主龙衍征。除去趋同演化的既有论调，这一部分主龙的确有可能是有共同祖先的；即使化石记录和基因谱系不支持这个论调，这说明两足直立也是主龙类的一个普遍而古老的特征。
到了晚三叠世早期，恐龙形态类进一步分化出基干恐龙形态类和恐龙形类。其中恐龙形态类的兔鳄，也演化出了与日后兽脚亚目极其相似的身体构造；科技龙则接近两足奔跑的鸟臀目。恐龙形类的马来鳄龙可能有羽毛并且和兽脚亚目高度相关。
兔蜥类似腔骨龙，而西里龙则是四足站立，非常接近日后的原蜥脚亚目的板龙和农神龙，说明部分恐龙形类放弃了两足站立。
龙，腔骨龙，月亮谷始盗龙和最近的一种未命名物种。晚三叠世晚期以后演化出的四足站立的基本是蜥脚类（除却慢龙），说明两足站立这个特征是兽脚亚目的祖征，也是最早演化出的形态，和恐龙形态类的部分冠群物种一脉相承。
