生前已确认归属关系，死后算不算遗产？

房屋所有权的转移应当以过户为准，因此该三层房屋还是属于老人的遗产。老人生前对房子有分配的，且兄弟之间没有争议的，可以按照分配原则办，兄弟之间签个分配协议，然后拿着老人的死亡证明可以去房管部门办理过户。相应的税款和手续费用是需要交纳的。

老人身前并未书面约定该房产归属权,死后也无遗嘱,老人将该房屋的二楼\三楼给儿子居住并非赠予行为.
该房产(三层)应当认定为老夫妻俩的共同财产,该房产目前市场价值的50%为去世老人的遗产,另50%为其配偶个人财产.根据<继承法>规定,无遗嘱的依据法定继承顺序继承:即死者的配偶\所有子女\死者的父母共同继承,一般同一继承顺序均等分割.
基于你所述情形过户一事较难办理,应需要该房产的所有继承人(包括死者配偶同意赠予或出售其个人财产部分)的签字同意,房产部门才办理过户申请.
两个儿子如果没和父亲一起出资建造，只是享有了居住使用权，并没有所有权，房子的一半归老人的配偶，另一半属于遗产范围

是老人的遗产,如果没有遗嘱则按照法定继承来处理,配偶和子女属于第一顺序的继承人,按照一般原则应该是继承人平分遗产.

二楼、三楼算老人财产

房产证过户一般要老人的死亡证明，然后遗嘱或者法定继承所有继承人到场，房产证、身份证什么然后交一定费用

现阶段我国还没有遗产税