脊索动物门和脊椎动物亚门的主要区别是什么？

一、形态特征不同

1、脊索动物门

位于消化道和神经管之间的一条棒状结构，具有支持功能，所有脊索动物的胚胎期具有脊索，但在以后的生活中或终生保留（尾索动物亚门、头索动物亚门），或退化并被脊柱（vertebral column）代替。

2、脊椎动物亚门

出现明显的头部，中枢神经系统成管状，前端扩大为脑，其后方分化出脊髓。大多数种类的脊索只见于发育早期（圆口纲、软骨鱼纲和硬骨鱼纲例外），以后即为由单个的脊椎骨连接而成的脊柱所代替。

二、生活习性不同

1、脊索动物门

柄海鞘的成体呈长椭圆形，幼体型似蝌蚪。基部以柄附生在海底或被海水淹没的物体上，另一端有2个相距不远的孔：顶端的一个是入水孔，孔内通消化管而中间有一片筛状的缘膜，其作用是滤去粗大的物体，只容许水流和微小食物进入消化道。

2、脊椎动物亚门

原生水生动物用鳃呼吸，次生水生动物和陆栖动物只在胚胎期出现鳃裂，成体则用肺呼吸。除圆口纲外，都具备上、下颌。

循环系统较完善，出现能收缩的心脏，促进血液循环，有利于提高生理机能。用构造复杂的肾脏代替简单的肾管，提高排泄机能，由新陈代谢产生的大量废物能更有效地排出体外。

三、下属物种不同

1、脊索动物门

包括尾索动物亚门、头索动物亚门、脊椎动物亚门。

2、脊椎动物亚门

该亚门包括圆口纲、软骨鱼纲、硬骨鱼纲、两栖纲、爬行纲、鸟纲和哺乳纲。

参考资料来源：百度百科-脊索动物门

参考资料来源：百度百科-脊椎动物亚门