如题所述
PCR产物直接测序，引物端约有几十个碱基是测不出来的，如果你恰好关注这个位置，那么或者从另一端测通（你的产物不长），或者克隆测序
此外，很多时候由于PCR产物不专一，直接测序效果不好，而克隆测序没这个问题，测序效果好于PCR产物测序。不过，如果你使用普通taq酶，PCR过程中会引入错误，用产物直接测序会掩盖这些错误，但克隆测序时则会保留这些错误。
此外，很多时候由于PCR产物不专一，直接测序效果不好，而克隆测序没这个问题，测序效果好于PCR产物测序。不过，如果你使用普通taq酶，PCR过程中会引入错误，用产物直接测序会掩盖这些错误，但克隆测序时则会保留这些错误。
温馨提示：答案为网友推荐，仅供参考
第1个回答 2013-01-22
PCR直接测序会存在或多或少的套峰，所以通常都采用双向引物测序，通过碱基互补原则来弥补单向没测出来的地方。克隆后测序就非常准确了，而且有时候PCR跑出来有杂带的话就必须克隆后再拿去测序了。我也涉入分子不久，希望回答能帮到你。
第2个回答 2013-01-24
模板会影响测序
