超声波能破碎DNA吗?

如题所述

我现在做原核表达一个融合蛋白,其中单链抗体基因是合成的(根据大肠杆菌的密码子偏爱性设计的),表达载体是PET和pGEX,做了几次表达好象蛋白都行成包涵体。
我想请教的问题是:
一 如何判断是不是形成包涵体,我们实验室那个破超声波破碎仪坏了,再没有超声波破碎仪的情况下如何破碎菌体,我配了下面二种裂解液
裂解液的成分:50mMTris-HCl, pH8.0, 2mM EDTA,100mM NaCl,加溶菌酶至100ug/ml,0.1%Triton X-100
裂解液:50mM Tris-HCl(pH8.5~9.0), 2mM EDTA, 100mM NaCl, 0.5% Triton X-100, 1mg/ml
再一起用我们那个破破碎仪超但根本打不动,最后我就用反复冻融法把其中二个在(37和-20反复冻融)感觉也不行,
请问大侠们,你们是如何破碎菌体的,反复冻融该怎么搞了?我看别人判断破碎是不是完全的标准是: 1,外观判断:超声前菌悬液是浑浊的,超声完全后变的透明、清澈。
这一项是一个比较常用的方法,以前我的师姐也这么告诉我的,但我超一个小时还没有透明?
2,液体的粘滞性:超声后菌液从枪头滴下不粘连。
这一项跟没有看到粘滞性,是不是我破碎时加的液体太多了,大家在超声时加什么缓冲液?比例是多少?
3,高速离心:有用高速离心检测超声破碎程度的(一般用6,000 g 10 min, 比一般离心收集菌体的转速高一点)。 沉淀是未破碎或破碎不完全的菌体。
高速离心检测时6,000 g是不是转速太低了,我们以前都20000g,离心后再跑胶检测?
4,染色:破碎后的菌液涂片,革兰氏结晶紫溶液染色0.5分钟,镜检
染色后看什么样的结果说明破碎完全了?
二 我在做原核表达时,表达载体是PET和pGEX,表达条件是:
诱导温度37度 [IPTG]=0.5mM 时间是3h
表达后检测是包涵体
怎么搞才能使蛋白形成可容性的蛋白?
下面的方法哪个更有效一些:
1 降低表达温度。(20-30度表达)
2 增加诱导时细菌密度。(OD大于1.0)
3 降低表达启动温度。(先将菌株冷至20度左右再诱导)
4 降低诱导剂的浓度。(如IPTG可小于0.1mM)
5 增加通气。(培养瓶中放入1/3左右的培养基,猛烈摇动,增加氧含量,抑制包涵体形成)
6 减少诱导时间。(2-4小时

大家能给推荐一些进口超声破碎仪的资料
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第1个回答  推荐于2016-12-02
细菌有坚硬的细胞壁,首先要破碎经胞。方
法有三种:①机械方法:超声波处理法、研磨法、匀浆法;②化学试剂法:用SDS处理细胞; ③酶解法:加入溶菌酶或蜗牛酶,都可使细胞壁破碎。

由于高等动物DNA 主要存在于细胞核与线粒体中,所以提取时有两个困难(高等植物与此类似):
①破碎细胞难;从处死动物٠分离组织器宫到破碎细胞费时长。在此时期间DNA 可能会被DN ase降解,而动物组织:特别是肌肉组织很难破碎,即使是较易破碎的肝٠肾等组织也往往使用组织匀浆器,易造成DNA 断裂。
②分子量大,一般比细菌的大2—3个数量级,比病毒的大4—5个数量。对不同生物材料,要根据具体情况选择适当的分离提取方法。本回答被提问者采纳

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