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多条氨基酸序列比对
使用mafft进行多
序列比对
答:
多
序列比对
(
多序列
联配,Multiple sequence alignment, MSA) 是指把
多条
(3 条或以上)有系统进化关系的蛋白质分子的
氨基酸序列
或核酸序列进行比对,尽可能地把相同的碱基或氨基酸残基排在同一列上。这样做的意义是,对齐的碱基或氨基酸残基在进化上是同源的,即来自共同祖先(common ancestor)。多序列...
如何利用DNAMAN进行多
序列比对
的同时
比对氨基酸
(如图)
答:
1、首先在电脑中打开DNAMAN软件,然后点击File,New,建立新的对话框。2、在新的对话框中输入需要翻译的碱基
序列
(可复制粘贴),并同时按住键盘的Ctrl和A将输入的序列选中,如图显示黑色。3、单击如图所示Seq,如果出现如图对话框,选择是或否时,单击“是”。如果没有出现可忽略此步。4、之后单击如图...
多
序列比对
后怎么设置每行
氨基酸
数目
答:
方法如下:1、点击Project,在点击Configure弹出配置界面。2、在点击Project,在点击EditSequencesList,即可修改
氨基酸序列
的顺序或者修改序列名称。
dnaman三个
氨基酸序列比对
相似度为什么比其中两个序列相似
答:
残留。dnaman三个
氨基酸序列比对
相似度比其中两个序列相似是因为有残留。氨基酸是构成动物营养所需蛋白质的基本物质。理化性质物理性质氨基酸为无色晶体,熔点超过200℃,比有机化合物的熔点高
很多
。
序列比对
名词解释
答:
序列比对
名词解释如下:为确定两个或多个序列之间的相似性以至于同源性,而将它们按照一定的规律排列。将两个或多个序列排列在一起,标明其相似之处。序列中可以插入间隔(通常用短横线“-”表示)。对应的相同或相似的符号(在核酸中是A, T(或U), C, G,在蛋白质中是
氨基酸
残基的单字母表示)...
Clustal x软件进行
序列比对
,怎样找出
氨基酸序列
无间隙保守区段...
答:
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氨基酸
辅助设计 clustal 软件
序列
搜索资料 本地图片 图片链接 代码 提交回答 匿名 回答自动保存中为...
同源序列查找、
多序列比对
、位点特异性反复比对
答:
在选择比对方式时,通常建议优先考虑蛋白质
序列比对
,因为它们较DNA序列更短,且包含20种
氨基酸
的丰富信息。挑选10-15条相关序列,下载到本地,然后在Mega这样的工具中轻松进行比对。不过,有些工具对于长度差异较大的序列处理可能不尽如人意,可能需要人工调整。对于在线比对,ExPASy-Clustal W是一个好选择...
基因多重
序列比对
是什么意思
答:
多重
序列比对
(Multiple sequence alignment;MSA)是对三个以上的生物学序列(biological sequence),如蛋白质序列、DNA序列或RNA序列所作的序列比对。一般来说,是输入一组假定拥有演化关系的序列。从MSA的结果可推导出序列的同源性,而种系发生关系也可引导出这些序列共同的演化始祖。如右图般的视觉化...
关于使用blaste进行
比对
的结果分析
答:
前面的数字表明是第几个
氨基酸
。+号表示性质相似的氨基酸。———Identities是完全一样的氨基酸,而Positives则是性质相似的氨基酸比例。下面的那三条序列,Query是数据库里的序列,sbjct是你提交的序列,中间的是两
条序列比对
的结果。懂么?
进行多
序列比对
为什么需要多种核苷酸和
氨基酸
替换矩阵
答:
如mega,DNAman或者是vector NTI里的比对工具都可以做比对。在比对结果里找到非常保守的区域就可以设计简并引物了。设计的简并引物可以根据经验公式自个算Tm值。不用计较打分的问题。因为你只能在保守区设计引物。图是做的DNA
序列比对
,有保守区和不保守区。我觉得,引物的3'端最好位于最保守的区域。
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