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怎么在NCBI上比对氨基酸序列
在NCBI中如何
查询基因的功能
答:
ORF是开放阅读框,指的是mRNA上编码
氨基酸
的那段
序列
,从AUG开始,直到终止子,但是不包括终止子。ORF的数据在进入
NCBI
主页的右下侧一个叫ORFfinder的超链接里,点击进去后输入相应序列的mRNA序列,然后再点击ORF find就可以预测处它的ORF,但是往往会有很多结果,一般来说第一个结果是真实的,其余的都是...
知道一条蛋白质的
氨基酸序列
,该
如何
了解它的三维结构是否已知呢?_百度...
答:
查一下,看看这是神马蛋白,再查是否有人已经发表过这种蛋白的三维结构。可以用
NCBI
查一下(我记得可以用那个Blast功能,
比对
蛋白),再在PubMed里面查一下有关该蛋白的消息,看看有没有关于三维结构的文章发表~
NCBI如何
下载蛋白质的核酸
序列
答:
若想要下载核酸序列,点击右上角的sent to→Complete Record→File→FASTA,就能下载全部的序列,若是想下载其中一段序列,可对准你想要的序列右击,在新标签页打开,然后步骤同上;若是想要下载
氨基酸序列
,通常每个核酸序列translation
里
都包含氨基酸序列,也可以点击里面的protein id,打开就是了。
单个基因的生物信息学分析-基因结构与功能分析
答:
三、基于以上分析,我们可以初步得到一段区间内的基因结构分析,也可以进行单个基因的结构分析。完成基因结构分析后,可以利用
ncbi
的blast或ensemble plant进行功能注释。如果是使用
氨基酸序列
,选择blastp;如果是基因序列,选择blastn。图7显示的是ensemble plant的blast,查看其在拟南芥
中
的同源基因。在这里,...
求助保守
序列
查找,引物设计
答:
如果:你研究的物种没有这个基因,就可以按下面步骤做。1:把你的基因名称粘贴
在NCBI
的蛋白质数据库中,进行搜索(这个比核酸数据库更保守一些)2:根据搜索到的结果,看下面列出的信息,有没有和你研究物种是近缘的(从分类上说的)3:下载10-20条左右的
氨基酸序列
(片段长度最好差不多、下载最好...
如何在NCBI中
下载乙型流感的
氨基酸序列
(要详细步骤)
答:
甲型流感病毒是变异最为频繁的一个类型,每隔十几年就会发生一个抗原性大变异,产生一个新的毒株,这种变化称作抗原转变亦称抗原的质变;在甲型流感亚型内还会发生抗原的小变异,其表现形式主要是抗原
氨基酸序列
的点突变,称作抗原漂移亦称抗原的量变。抗原转变可能是血凝素抗原和神经氨酸酶抗原同时转变,称作...
如何
利用生物信息学研究一个蛋白分子
答:
生物信息学的蛋白分子研究通常包括以下几个步骤:1.蛋白质序列分析 利用生物信息学工具和数据库(例如
NCBI
、UniProt)获取蛋白质的
氨基酸序列
。进行
序列比对
,发现序列的保守区域或者特异性,通过多序列比对来分析蛋白质家族内的相关性。2.结构生物信息学分析 利用蛋白质结构数据库(例如PDB)获取或预测蛋白质...
已知一个基因名称和它的
序列
,
怎样
明确找出该基因功能区(N端或C端...
答:
1. 利用基因
比对
功能。进入
NCBI
网站,点击BLAST,输入基因
序列
,找到与之同源度最高的基因,点击进入后,会告诉你这个基因的详细信息,包括哪儿是外显子,哪儿是内含子,等等。2.利用生物信息学软件。应用GeneScan软件,专门用来分析基因的一款软件,输入基因序列,同样会告诉你该基因的详细信息。建议用1最...
在NCBI
blast中找到一个蛋白的同源蛋白后,
如何
确定这些同源蛋白是否被...
答:
NCBI上对于这些同源蛋白的名字已经有了明确的规定了,可以去NCBI上搜索这些蛋白,结果里会包含这些蛋白的详细信息,包括碱基序列,
氨基酸序列
等。同样,
在NCBI上
检索关于这些同源蛋白的文章,就可以知道这些蛋白是否被研究过了。望采纳
如何在NCBI中
下载乙型流感的
氨基酸序列
(要详细步骤)
答:
回答:流感病毒结构自外而内可分为包膜、基质蛋白以及核心三部分。在感染人类的三种流感病毒中,甲型流感病毒有着极强的变异性,乙型次之,而丙型流感病毒的抗原性非常稳定。甲型流感病毒是变异最为频繁的一个类型,每隔十几年就会发生一个抗原性大变异,产生一个新的毒株,这种变化称作抗原转变亦称抗原的...
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