如题，在blast的时候是否要保留当时做dna扩增时的pcr引物序列。……以前做的一个系列是通过提取重组质粒测序，不去引物的，但是现在做的内容是用pcr产物直接测序，所以结果里没有pcr扩增引物，这样该如何处理？谢谢
什么跟什么 说的太不清楚饿了 只要你需要的那段序列是对的不就行了嘛 跟引物序列有啥关系 毕竟大部分的PCR引物设计都是在需要的序列两端隔一段距离 而且如果你测序是拿PCR引物测的话 那前面的几十个碱基都是测不准的追问
就是，原来做的样品，在比对的时候是保留引物的（引物是实验室根据genbank上的序列自行设计的），而现在做的样品，在ncbi上查到的一些序列也是带有pcr引物的（通用引物），一些则不带，而我们是用pcr直接测序，这样的结果是不带引物的，去除头尾的碱基后再去比对，这样子得到的结果是可以的吗？谢谢
追答不好意思我还不是很明白
不过我的意思是带不带引物都不会影响你比对的结果 对吧 只要引物中间的部分序列是正确的 有没有引物那部分序列都可以比对正确
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