PCR跑胶的目的是找到目的片段,我们怎么知道哪个是我们要的目的片段呢

如题所述

1 预先已知到目的片段的大小,PCR跑胶验证该大小的片段是否跑出来,点Marker就可以区别;

2 预先未知到目的片段的大小,比如5‘RACE PCR,这将出现的片段(一般是最大的条带)克隆,测序,然后看是不是所要的带追问

如果我们不知道目的片段有多少个碱基 如果去选择Marker啊 O(∩_∩)O谢谢

追答

你用一个范围大一点的Marker就行了,比如Fermentas的1Kb ladder,从250bp到10Kb

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第1个回答  2011-03-29
电泳时一定让样品和Marker一起跑,根据位置确定片段大小,根据比对其他物种相应片段的大小,推测其是否可能是目的片段。 常用的DNA Marker有:λ / HindIII DL5000追问

但是如果我们不知道目的片段含有多少个碱基呢 怎么去比对呢

第2个回答  2011-03-29
还可以检测扩增的特异性。电泳时跟Marker一起跑,根据位置确定片段大小,根据比对其他物种相应片段的大小,推测其是否可能是目的片段,当然,最终的确定是根据测序结果。

----中国西部生命科学论坛追问

但是如果我们不知道目的片段有多少个碱基呢 怎么去比对呢

追答

引物如何设计出来的?是不是根据别的物种序列,找到别的物种该序列上设计引物的位置,确定中间的碱基数,你的目的片段长度应该和这个差不多。再根据电泳结果中你的片段相对于Marker的位置推测其大小。

第3个回答  2012-05-11
设计引物的时候你就应该知道是多大片段了啊,不然你的引物是怎么设计出来的?

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