请问分机构原来是独立核算，目前要跟总机构合并申报企业所得税可以吗？

可以，独立核算跟汇总申报企业所得税也不矛盾。关键要看分支税务局的态度，税务局同不同意汇总缴纳企业所得税都是合理的。比如总机构就是一管理机构，不产生多少利润，而公司利润大部分由分支机构创造，这时候分支机构所在地税务局就可能不同意汇总申报，如果情况相反，则会同意汇总申报，他们也有业绩考核。

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