蒙古军队明明比满清军队强大得多，为什么蒙古灭掉南宋，比满清灭掉南明难得多？

首先，南宋比南明多经营了百余年，数代皇帝打造的长江防线将南宋王朝的都城临安拱卫得如铁桶一般。因此，蒙古后来也是不得不借道大理才算是迂回到了南宋的腹地进行灭宋之征。而南明只是临时推举出来的割据政权，本身就人心不齐，而且战力低下。加之南明也并未具备防范整个长江防线的能力，所以自然很轻易的就被清军攻破了南京。

而且从战略上说，蒙古军的敌人可不仅仅是一个南宋，从成吉思汗开始，蒙古军队就已经开始扫荡世间的每一寸土地。忽必烈继承皇位后依然保持着这种传统，灭南宋、征日本、打安南等地。其实这并非蒙古人的全部军力，然而八旗却是在实实在在解决了蒙古与朝鲜问题之后专心对付大明，缺少了后顾之忧与分散心思的东西。

南宋由于都城距离长江太近，其军事重心就被放在了长江各段上，例如钓鱼城防线和襄樊防线等。由于崇祯死前的失误抉择，明军残余虽在江南仍有一战之力，却与南宋完全天壤之别。经过登莱兵变后明军的火器技术与整编制的精锐部队都丧失殆尽。这些在南明虽不说是完全没有，但与孔有德麾下的人马相比就差太多了。

南明的内部争斗太严重，对招安的各种角色也过分的抱有幻想，完全没有南宋初年那种万众一心的思维。即使有李定国这样忠心的角色也因为孙可望的私心而分道扬镳，最终导致了南明最后一朝的终结。因此说来，虽然两朝最终都步向灭亡的道路，从本质上来说还是有很大不同的。