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蛋白质信号肽的预测工具
SignalP-6.0
:
信号肽预测
答:
SignalP-6.0
,一款功能强大的蛋白质信号肽预测工具,专为生物学家打造,支持古菌、细菌和真核生物的信号肽识别。它具备卓越的预测能力,能准确识别五种主要的信号肽类型,如Sec/SPI和Tat/SPI等,为您的研究提供了关键的序列信息。然而,它的使用并非无限制,最大支持上传5000个序列,每个序列长度不得超...
信号肽
分析图怎么看signal5
答:
无法看。
SignalP是一个专用于分析信号肽的软件
,基本常用来预测信号肽中的分泌蛋白,但SignalP5.0截止到2023年4月,还并没有完善此功能,不能对SPII进行预测,所以无法看。信号肽是引导新合成的蛋白质向分泌通路转移的短(长度5-30个氨基酸)肽链。
蛋白质
序列分析路线图和
工具
都是什么?
答:
2、蛋白质序列分析工具如下:(1) 跨膜区预测
。方法:输入待分析的蛋白序列即可。(2) 信号肽预测。方法:输入待分析的蛋白序列,如为原核基因选择原核训练集,否则选择真核训练集。(3) 亚细胞定位预测。推荐使用
PSORT
软件对PDCD5蛋白的细胞内定位进行预测。PSORT将动物蛋白质定位于10个细胞器:(1)细胞...
对16S rRNA可以进行哪些分析(包括方法)??
答:
1.预测蛋白质的分子量及等电点:ExPASy(Compute
pI/Mw)2.分析蛋白质的基本物理化学性质:ExPASy(ProtParam)3.分析蛋白质的亲水性和疏水性:ExPASy(ProtScale)4.分析蛋白质在各种蛋白酶和各种化学试剂处理后的内切产物:ExPASy(PeptideMass) 5.分析蛋白质的信号肽:ExPASy(
SignalP
)6.预测蛋白质的...
...
预测蛋白质
等电点,跨膜区域,
信号肽
,二级结构预测?
答:
第一个问题你可以转换成FASTA格式
,或者把所有的序列在NCBI中用BLAST两两对比。蛋白类的我不懂,不便说。PCR退火温度一般式设计软件Tm减去1-3度,根据实验调整
信号肽预测
图怎么看
答:
看信号肽
预测
图可看分泌
蛋白
的N端。信号肽预测信号肽位于分泌蛋白的N端,当蛋白跨膜转移位置时被切掉前预测其是否具有信号肽剪切位点。
信号肽的
特征是包括一个正电荷区域、一个疏水性区域和不带电荷但具有极性的区域。
请问一个
预测蛋白质
表达部位的网站或软件(亚细胞定位)
答:
http://www.cbs.dtu.dk/services/
SignalP
/ 没有能告诉你具体亚细胞定位的软件和网站。只有通过预测该蛋白有没有信号肽或跨膜域来判断该蛋白是膜蛋白或可溶性蛋白。
信号肽
分析图怎么看
答:
3、然后观察氨基酸序列,信号肽分析图会显示
蛋白质
序列的氨基酸组成,可以观察信号肽区域的氨基酸组成,特别是是否包含特定的信号肽特征序列。4、然后根据信号肽分析图提供的信息,可以评估蛋白质序列中是否存在
信号肽的
可能性,一些
工具
会给出一个得分或概率,指示信号肽存在的可能性。5、最后参考其他分析结果...
16个常用生物信息在线
工具
答:
启动子区预测 工具:Promoter Scan 地址: http://www.cbs.dtu.dk/services/Promoter/ 蛋白质一级结构分析 工具:PredictProte 地址: https://www.predictprotein.org/home 工具:ExPASy-ProtParam tool 地址: http://web.expasy.org/protparam/ 信号肽 工具:
SignalP
地址: http://www.cbs.dtu....
生物信息学常用的软件有哪些?
答:
ExPASy(PeptideMass) [* :kinase K]5.分析蛋白质的信号肽:ExPASy(
SignalP
)6.预测蛋白质的二级结构:ExPASy(Jpred 3)多物种分子系统发育分析:EMBL(www.ebi.ac.uk/embl/)--Toolbox--Clustal2W 人脂联素蛋白质序列:NP_004788 人类胰岛素生长因子IB前体:P05019 ...
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